การใช้เทคนิค LOOP-MEDIATED ISOTHERMAL AMPLIFICATION (LAMP) ตรวจหาเชื้อราไฟทอปธอราในทุเรียน

ผู้แต่ง

  • Dueantem Thongphueak -
  • จิรภัทร จิรภัทร
  • ศิริรัตน์ วชิรเลอพันธุ์
  • สุพิชฌาย์ อัครวริศวงษ์

คำสำคัญ:

ไฟทอปธอรา , ปาล์มมิโวลา , ดีเอ็นเอไบโอเซ็นเซอร์แบบแถบ , แลมป์

บทคัดย่อ

งานวิจัยนี้ศึกษาการเกิดโรครากเน่าและโคนเน่าของทุเรียนจากเชื้อ Phytophthora palmivora โดยเก็บตัวอย่างจากต้นทุเรียนที่แสดงอาการของโรคจากสวนทุเรียนในอำเภอเขาคิชฌกูฏ และอำเภอแก่งหางแมว จังหวัดจันทบุรี จำนวน 20 ตัวอย่าง พบเชื้อรา P.  palmivora จำนวน 12 ตัวอย่าง และตรวจไม่พบเชื้อ P. palmivora จำนวน 8 ตัวอย่าง จากการคัดแยกเชื้อและศึกษาลักษณะทางสัณฐานวิทยาของ P. palmivora โดยการเลี้ยงเชื้อราบนสไลด์ พบว่า เชื้อที่แยกได้มีรูปร่างลักษณะของโคโลนีเป็นแบบ Rosette สปอร์แรงเจียมมีลักษณะเป็นวงรี เป็นแบบ Ovoid ภายใต้กล้องจุลทรรศน์ การเพาะเลี้ยงบนอาหารวุ้นแครอท พบว่า สามารถเจริญเติบโต
ได้ดี การตรวจวิเคราะห์เชื้อ P. palmivora โดยการเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอด้วยเทคนิคแลมป์ (LAMP) ร่วมกับดีเอ็นเอไบโอเซ็นเซอร์แบบแถบ (Dipstick DNA biosensor) พบว่า สามารถตรวจจับกับยีนเป้าหมายได้ทั้ง 12 ตัวอย่าง การตรวจสอบความไว พบว่า ความเข้มข้นต่ำสุดที่สามารถตรวจสอบเชื้อได้ คือ 10-5 ไมโครกรัมต่อมิลลิลิตร การตรวจสอบความจำเพาะของไพรเมอร์กับเชื้ออื่น พบว่า ไม่เกิดปฏิกิริยาการข้ามกับเชื้อราอื่นๆ แสดงว่าวิธีการวิเคราะห์มีความจำเพาะเจาะจงต่อเชื้อ P. palmivora ดังนั้น วิธีตรวจวิเคราะห์เชื้อรา P. palmivora ในทุเรียน ด้วยเทคนิคแลมป์ร่วมกับดีเอ็นเอไบโอเซ็นเซอร์แบบแถบเป็นวิธีการที่ทำได้อย่างรวดเร็ว มีความแม่นยำสูง สามารถทำได้ง่าย โดยไม่ต้องใช้เครื่องมือที่มีราคาแพง ภายในเวลา 60-90 นาที และใช้ปริมาณดีเอ็นเอเพียงเล็กน้อย การตรวจวิเคราะห์เชื้อได้อย่างรวดเร็วและมีประสิทธิภาพ สามารถใช้เทคนิคนี้เพื่อเฝ้าระวังและควบคุมการแพร่ระบาดของโรคได้

References

Alvarez, E., Marroquín-Guzmán, M., Mejía, J.F., & Pardo, J.M. (2010). Early detection of Phytophthora palmivora in oil palm, using real-time polymerase chain reaction (QPCR) and molecular beacon probes. APS Caribbean Division, 101, S253-S256.

Dai, T., Wu, X., & Kang, Z. (2015). LAMP (loop-mediated isothermal amplification) detection primer combination for phytophthora palmivora, and LAMP detection kit and LAMP detection method thereof CN 104313176 A. Rui test precision medical testing (Shanghai) Co., Ltd.

Hunter, J., & Kunimoto, R. (1974). Dispersal of Phytophthora palmivora. Phytopathology, 64, 202-206.

Li, Y., Fan, P., Zhou, S., & Zhang, L. (2017). Loop-mediated isothermal amplification (LAMP): A novel rapid detection platform for pathogens. Microbial pathogenesis, 107, 54-61.

Lim, T., & Chan, L. (1986). Fruit rot of durian caused by Phytophthora palmivora. PERTANIKA., 9(3), 269-276.

Lü, P., He, Y., Lin, F., Pan, Y., Yu, Q., Guo, Z., . . . Fu, Y. (2019). Rapid detection of Bombyx mori bidensovirus by loop-mediated isothermal amplification based lateral flow dipstick assay for field applications. Journal of invertebrate pathology, 163, 75-81.

Notomi, T., Mori, Y., Tomita, N., & Kanda, H. (2015). Loop-mediated isothermal amplification (LAMP): principle, features, and future prospects. Journal of microbiology, 53(1), 1-5.

Sangchote, S., Poonpolgul, S., Sdoodee, R., Kanjanamaneesathian, M., Baothong, T., & Lumyong, P. (2004). 4.3 Phytophthora Diseases in Thailand. Diversity and management of Phytophthora in Southeast Asia, 77, 1-102.

Sattabongkot, J., Tsuboi, T., Han, E.-T., Bantuchai, S., & Buates, S. (2014). Loop-mediated isothermal amplification assay for rapid diagnosis of malaria infections in an area of endemicity in Thailand. Journal of clinical microbiology, 52(5), 1471-1477.

Tomita, N., Mori, Y., Kanda, H., & Notomi, T. (2008). Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) of gene sequences and simple visual detection of products. Nature protocols, 3(5), 877-882.

Zasada, A.A., Wiatrzyk, A., Czajka, U., Brodzik, K., Formińska, K., Mosiej, E., . . . Wdowiak, K. (2020). Application of loop-mediated isothermal amplification combined with colorimetric and lateral flow dipstick visualization as the potential point-of-care testing for Corynebacterium diphtheriae. BMC Infectious Diseases, 20(1), 1-9.

Downloads

เผยแพร่แล้ว

2022-12-28

How to Cite

Thongphueak, D., จิรภัทร จ., วชิรเลอพันธุ์ ศ. . ., & อัครวริศวงษ์ ส. . . (2022). การใช้เทคนิค LOOP-MEDIATED ISOTHERMAL AMPLIFICATION (LAMP) ตรวจหาเชื้อราไฟทอปธอราในทุเรียน. PSRU Journal of Science and Technology, 7(3), 1–14. สืบค้น จาก https://ph01.tci-thaijo.org/index.php/Scipsru/article/view/249876

ฉบับ

บท

บทความวิจัย