ความสัมพันธ์ระหว่าง SNP ของยีน VLDL/VTG receptor กับลักษณะการให้ผลผลิตไข่และการเจริญเติบโตของไก่ชนิดต่าง ๆ
คำสำคัญ:
chicken, very low density lipoprotein/vitellogenin receptor gene, single nucleotide polymorphismบทคัดย่อ
ยีนความหนาแน่นต่ำมากไลโพโปรตีนและไวเทลโลจีนินรีเซฟเตอร์ (Very Low Density Lipoprotein/Vitellogenin; VLDL/VTG receptor) เป็นยีนที่มีความสำคัญมากในการให้ผลผลิต
ไข่ของไก่ งานวิจัยนี้ศึกษาความหลากหลายของยีน VLDL/VTG รีเซฟเตอร์ ในไก่ทั้งหมด 4 สายพันธุ์
ซึ่งประกอบด้วย ไก่พันธุ์โร๊ดไอแลนด์เรด (Rhode Island Red; RR), ไก่พันธุ์เล็กฮอน์ขาว (Single-Comb White Leghorn; WL), ไก่ไข่สายพันธุ์ทางการค้า (HyLine brown; HL) และ ไก่ต่อ โดยใช้เทคนิคพอลิเมอร์เรสเชนรีแอกชั่น (Polymerase Chain Reaction) เพิ่มปริมาณยีน VLDL/VTG receptorและทำการออกแบบไพร์เมอร์ที่มีความจำเพาะต่อยีนดังกล่าว เป็นบริเวณทั้งสิ้น 1 ตำแหน่ง ในส่วนที่เรียกว่า 5´ flanking region ของยีน VLDL/VTG receptor ที่บริเวณตำแหน่ง -1351 ถึง-1599 จากการวิเคราะห์บริเวณ 5´flanking region ของยีน VLDL/VTG receptor พบว่ามี SNPs คือ A-1393G ผลการตรวจสอบความสัมพันธ์ระหว่าง SNPs กับลักษณะการให้ผลผลิตไข่ และการเติบโตของไก่ พบว่า น้ำหนักตัว (BW) น้ำหนักไข่ฟองแรก (EW) ค่าสี b ที่วัดได้จากเปลือกไข่ ใน genotype AAมีค่าสูงกว่า GG อย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ (p<0.05) ในขณะที่ ค่าสี (ESC) และค่าสี L ของเปลือกไข่ ใน genotype AA มีค่าน้อยกว่า GG อย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ (p<0.05) นอกจากนี้ยังพบความสัมพันธ์เชิงบวกระหว่าง BW และ EW (0.712) BW และ ค่าสี a (0.435) และ EW และ ค่าสี a (0.642) ในขณะที่ ค่าสี a กับ ค่าสี L ที่วัดได้จากเปลือกไข่ ESC และ BW, ESC และ EW มีความสัมพันธ์เชิงลบ โดยมีค่าความสัมพันธ์เป็น -0.833, -0.320 และ -0.545 ตามลำดับ จึงกล่าวได้ว่ายีน VLDL/VTG receptor gene อาจเป็น candidate gene ที่สำคัญที่มีความสัมพันธ์กับลักษณะการให้ผลผลิตไข่และการเติบโตของไก่
References
Baylan M, Celik LB, Akpinar GC. et al. Influence of eggshell colour on egg yolk antibody level, incubation results, and growth in broiler breeders, Revista Brasileira de Zootecnia. 2007; 46, 5-12.
Bujo H, Hermann M, Kaderli MO. et al. Chicken oocyte growth is mediated by an eight ligand binding repeat member of the LDL receptor family, The Embo Journal. 1994; 13:65-75.
Bujo H, Yamamoto T, Hayashi K. et al. Mutant oocytic low density lipoprotein receptor gene family member causes atherosclerosis and female sterility, Proceedings of the National Academy of Sciences. 1995; 92: 5-9.
Cao DG, Zhou Y, Lei QX. et al. Associations of very low density lipoprotein receptor (VLDLR) gene polymorphisms with reproductive traits in a Chinese indigenous chicken breed, Journal of Animal and Veterinary Advances. 2012; 11: 62-67.
Nimpf J, Schneider, WJ. Receptor-mediated lipoprotein transport in laying hens, The Journal of Nutrition. 1991; 121: 71-74.
Novak S, Hiesberger T, Schneider WJ. et al. A new low density lipoprotein receptor homologue with 8 ligand binding repeats in brain of chicken and mouse, Journal of Biological Chemistry. 1996; 271: 32- 36.
Rodriguez JN, Bon E, Menn FL. Vitellogenein receptor during vitellogenesis in the rainbow trout (Oncorhynchusmykiss), The Journal of experimental Zoology. 1996; 274: 63-70.
Shen X, Steyrer E, Retzek H. et al. Chicken oocyte growth: receptor-mediated yolk deposition, Cell and Tissue Research. 1993; 272: 59-71.
Yaemkong, S. Diversity of phenotypic characteristics of Thai indigenous chickens in Phitsanulok province, Rajabhat Journal of Sciences, Humanities & Social Sciences. 2014; 15: 63-73.
Takahashi S, Kawarabayasi Y, NaKai T. t al. Rabbit very low density lipoprotein receptor: A low density lipoprotein receptor-like protein with distrinct ligand specificity, Proceeding of the National Academy of Sciences U.S.A. 1992; 89: 52-56.
Takahashi S, Sakai J, Fujino T. et al. The very low density lipoprotein (VLDL) receptor–a peripheral lipoprotein receptor for remnant lipoproteins into fatty acid active tissues. Molecular and Cellular Biochemistry. 2003; 248: 21-27.
Wang C, Li SJ, Yu WH. et al. Cloning and expression profiling of the VLDLR gene associated with egg performance in duck (Anasplatyrhynchos). Genetics Selection Evolution. 2011; 43: 29.
Wyne KL, Pathak RK, Seabra MC, et al. Expression of the VLDL receptor in endothelial cells, Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology. 1996; 16: 7-15.
Wu Y, Pi JS, Pan AL.et al. Two novel linkage SNPs of VLDLR gene intron 11 are associated with laying traits in two quail populations, Archivfuer Tierzucht. 2015; 58: 1-6.
Yagyu H, Lutz EP, Kako Y. et al. Very low density lipoprotein (VLDL) receptor-deficient mice have reduced lipoprotein lipase activity possible causes of hypertriglyceridemia and reduced body mass with VLDL receptor deficiency, Journal of Biological Chemistry. 2002; 277: 37-43.
Yao JF, Chen ZX, Xu GY. et al. Low-density lipoprotein receptor-related protein 8 gene association with egg traits in dwarf chickens, Poultry Science. 2010; 89: 83-86.
Zhan H, Feng Y, Shen S. et al. Polymorphisms of chicken oocyte vitellogenesis receptor gene (ovr) and association with egg traits of chickens, Journal of Agricultural Biotechnology. 2009; 17: 67-71.
Zhang K, Qin Z, Chen T. et al. HapBlock: haplotype block partitioning and tag SNP selection software using a set of dynamic programming algorithms, Bioinformatics. 2004; 21: 31-34.
Downloads
เผยแพร่แล้ว
How to Cite
ฉบับ
บท
License
Each article is copyrighted © by its author(s) and is published under license from the author(s).
0-5526-7000 Ext. 7230
