ความแปรปรวนทางพันธุกรรมของพ่อ แม่พันธุ์ปลาเลียหิน (Garra cambodgiensis) เพื่อการฟื้นฟูประชากรในแม่นํ้ากอน จ.น่าน Genetic Variation of Broodstocks Stonelapping Minnow (Garra cambodgiensis) for Population Restoration in Kon River, Nan Province

Article Sidebar

PDF
Published: Dec 18, 2017
Keywords:
แม่นํ้ากอน Kon River ปลาเลียหิน Garra cambodgiensis ความแปรปรวนทางพันธุกรรม Genetic Variation

Main Article Content

เชาวลีย์ ใจสุข
Faculty of Sciences and Agricultural Technology, Rajamangala University of Technology Lanna
อมรชัย ล้อทองคำ
Faculty of Sciences and Agricultural Technology, Rajamangala University of Technology Lanna
พัชรา นิธิโรจน์ภักดี
Faculty of Agro-Industrial Technology, Rajamangala University of Technology Tawan-ok, Chantaburi Campus

Abstract

บทคัดย่อ
ความแปรปรวนทางพันธุกรรมเป็นข้อมูลสำคัญที่จะเป็นประโยชน์ต่อการดำเนินงานการอนุรักษ์และฟื้นฟูประชากรปลาท้องถิ่นในแหล่งนํ้าธรรมชาติ การศึกษานี้จึงประเมินความแปรปรวนทางพันธุกรรมของ
กลุ่มตัวอย่างพ่อพันธุ์และแม่พันธุ์ปลาเลียหินที่นำมาเพาะพันธุ์เพื่อปล่อยลูกพันธุ์สู่แหล่งนํ้าธรรมชาติบริเวณลำนํ้ากอน (ลำนํ้าสาขาของแม่นํ้าน่านตอนบน) โดยเครื่องหมายไมโครแซทเทลไลท์ 5 ตำแหน่ง
ผลการศึกษาพบว่าเครื่องหมายทั้ง 5 ตำแหน่ง มีความหลากรูปแบบ (Polymorphic) โดยพ่อพันธุ์ และแม่พันธุ์ มีจำนวนอัลลีลต่อตำแหน่ง (A) 10.4 และ 10.2 ค่า Allelic richness (Ar) 10.31 และ 9.96
ค่าเฮตเทอโรไซโกซิตี้จากการสังเกต (Ho) 0.58 และ 0.67 และค่าเฮตเทอโรไซโกซิตี้จากการคาดหมาย (He) 0.82 และ 0.83 ผลรวมที่เครื่องหมายทุกตำแหน่งกลุ่มตัวอย่างพ่อพันธุ์และแม่พันธุ์อยู่ในสมดุล
ฮาร์ดี - ไวน์เบิร์ก สำหรับผลการวิเคราะห์ความต่างทางพันธุกรรมพ่อ พันธุ์และแม่พันธุ์มีค่าระยะห่างพันธุกรรม 0.512 และมีค่าสัมประสิทธิ์เอฟ FST 0.0621 (95 % CI 0.039 - 0.091) ผลการประเมินจำนวน Effective Population Size (Ne) ทั้ง 2 กลุม่ ตัวอย่างมี Ne ไม่จำกัด ผลจากการศึกษานี้แสดงถึงประชากรปลาเลียหินในลำนํ้ากอนมีความเหมาะสมต่อการนำมาเพาะพันธุ์เพื่อการฟื้นฟูประชากรธรรมชาติในพื้นที่ศึกษา


Abstract
The genetic variation is the important data for restoration and conservation of local fish population. This study evaluated the genetic variation of Garra cambodgiensis broodstocks in Kon River, the tributary of upper Nan River. The finding showed that all of the five microsatellite loci were polymorphic. The genetic variation within male and female populations were not different, the average number of allele per locus (A) 10.4, 10.2, allelic richness (Ar) 10.31, 9.96, observed heterozygosity (Ho) 0.58, 0.67 and expected heterozygosity (He) 0.82, 0.83 for male and female respectively. At all loci both populations were in Hardy-Weinberg equilibrium. The genetic differentiation between male and female, the genetic distance = 0.512 and FST  = 0.0621 respectively (95 % CI 0.039 - 0.091). Moreover, the effective population size (Ne) in both samples were infinite. Based on the results of this study, the broodstock are suitable for breeding plan and population restoration in Kon River.

Article Details

How to Cite
[1]
ใจสุข เ., ล้อทองคำ อ., and นิธิโรจน์ภักดี พ., “ความแปรปรวนทางพันธุกรรมของพ่อ แม่พันธุ์ปลาเลียหิน (Garra cambodgiensis) เพื่อการฟื้นฟูประชากรในแม่นํ้ากอน จ.น่าน Genetic Variation of Broodstocks Stonelapping Minnow (Garra cambodgiensis) for Population Restoration in Kon River, Nan Province”, RMUTI Journal, vol. 10, no. 3, pp. 59–66, Dec. 2017.
Issue
Vol. 10 No. 3 (2017): September-December
Section
Research article

References

[1] Chistiakov, D.A., Hellemans, B, and Volckaert, A. M. (2006). Microsatellites and Their Genomic Distribution, Evolution, Function and Applications: A Review with Special Reference to Fish Genetics. Aquaculture. Vol. 255. Issues 1-4. pp. 1-29

[2] Salah M. Aljanabi and Iciar Martinez. (1997). Universal and Rapid Salt-Extraction of High Quality Genomic DNA for PCR-Based Techniques. Nucleic Acids Research. Vol. 25. No. 22. pp. 4692-4693

[3] Jaisuk, C., Lothongkum,A., Keereelang,J. and Sriyam, S. (2014). Development of Microsatellite Primers for Genetic Diversity Assessment of Local Fishes in Nan River. Rajabhat Journal of Science, Humanities and Social Sciences. Vol. 15. No. 2. pp. 12-22 (in Thai)

[4] Su L.W., Liu Z.Z., Wang C.T., Zeng Z., Liu A.Y., Tang W.Q., Yang J.Q. (2013). Isolation and Characterization of Polymorphic Microsatellite Markers in the Fish Garra orientalis (oriental sucking barb). Conservation Genetic Resource. Vol. 5. pp. 231-233

[5] Peakall, R. and Smouse, P.E. (2006). GENALEX 6: Genetic Analysis in Excel. Population Genetic Software for Teaching and Research. Molecular Ecology Notes. Vol. 6. Issue 1. pp. 288-295. DOI: 10.1111/j.1471-8286.2005.01155.x

[6] Goudet, J. (2001). FSTAT, A Program to Estimate and Test Gene Diversities and Fixation Indice (version2.9.3). (Computer Software). Switzerland: University of Lausanne.

[7] Rousset, F. (2008). GENEPOP’007: A Complete Reimplementation of the GENEPOP Software for Windows and Linux. Molecular Ecology Resources. Vol. 8. pp. 103-106. DOI: 10.1111/j.1471-8286.2007.01931.x

[8] Do, C., Waples, R.S., Peel, D., Macbeth, G.M., Tillett, B.J. and Ovenden, J.R. (2014). NeEstimator V2: Re-Implementation of Software for the Estimation of Contemporary Effective Population Size (Ne) from Genetic Data. Molecular Ecology Resources. Vol. 14. Issue 1. pp. 209-214. DOI: 10.1111/1755-0998.12157

[9] Shabani, A., Askari, G. and Moradi, A. (2013). Genetic Variation of Garra rufa fish in Kermanshah and Bushehr Provinces, Iran, Using SSR Microsatellite Markers. Molecular Biology Research Communications. Vol. 2. No. 3. pp. 81-88

[10] Na-Nakorn, U. (2000). Genetics of Aquatic Animals. 2nd ed. Bangkok: Kasetsart University Publisher. (in Thai)

[11] Sodsuk, K, P., Praipanapong, S., Sainin, N., Sodsuk, S. and Pewnain, P. (2012). Microsatellite-Based Analysis of Genetic Variation in Hatchery Populations of Asian seabass, Lates Calcarifer (BLOCH, 1790). Thai Journal of Genetics. Vol. 5. No. 2. pp. 166-182 (in Thai)

[12] Kamonrat, W. (255). Genetic Diversity of Barbonymus Gonionotus and Henicorhynchus Siamensis Populations in the Lower Mun River Ater Restocking Programme: A Case Study in Pak-Mun Dam. Thai Fisheries Gazette. Vol. 61. No. 6. pp. 493-497 (in Thai)